Les différentes parties de la Maison du squelette (qui avaient été dans le passé trois habitations distinctes) s'organisaient autour d'un atrium couvert dépourvu de compluvium. Chacun des trois espaces était éclairé par un puits de lumière : au centre un oecus s'ouvrait sur une cour en forme de nymphée ; à droite, un ensemble de pièces, dont un cubiculum, était eclairé par une trouée entre deux murs ; enfin l'aile gauche de la demeure était occupée par un triclinium ouvert lui aussi sur un nymphée que l'on voit ici avec ses concrétions calcaires caractéristiques de l'opus quadratum, surmonté d'une frise en mosaïque de pâte de verre à fond bleu décorée de sujets agrestes et mythologiques : un berger, des tritons surmontant une guirlande de feuillages, un offrant avec une biche et Dionysos, couché sur un lit de table. Les panneaux étaient séparés par des coquilles que l'on discerne encore.